Paavi Aleksanteri myrkytetään ja kamppailee hengestään. Kardinaalit käyvät kilpaa paavin asemasta.
Paavi Aleksanteri antaa kardinaali Sforzalle inkvisitiotehtävän.
Alfonso hylkää Lucrezian hääyönä, ja Lucrezia hakee tukea veljeltään.
Sisar nostaa kardinaali Farnesen tärkeään virkaan. Aleksanteri ehdottaa ristiretkeä.
Cesaren diplomaattimatka Ranskaan on menestys. Lucrezia juonii kuningas Ferdinandia vastaan.
Aleksanteri suostuu vastahakoisesti Cesaren suunnitelmiin tuhota Sforzan dynastia.
Cesare polttaa Constanzon palatsin estääkseen ruton leviämisen. Micheletto rakastuu Pascaliin.
Catherina suunnittelee pilaavansa Aleksanterin juhlat. Juoni Borgioiden huijaamiseksi paljastuu.
Cesare ja Lucrezia ovat jälleen yhdessä, mutta Alfonso alkaa epäillä heitä. Micheletto katoaa.
Aleksanteri ja Cesare solmivat sovun. Cesare vannoo, että Lucrezia kuuluu hänelle iäksi.
