Rodrigo voittaa vaalin lahjomalla ja uhkailemalla, ja hänestä tulee paavi Aleksanteri VI.
Paavi Aleksanteri VI ei kursaile vallantavoittelussa vaan nimittää lapsensa korkeisiin virkoihin.
Rodrigo yrittää kerätä varallisuutta avioliitolla Lucrezian kanssa. Samalla hän saa Milanosta liittolaisen.
Lucrezian häät ovat katastrofi. Borgian lasten avioton äiti saapuu.
Aviomiehensä hyljeksimällä Lucrezialla on suhde. Cesare tekee kaupat Machiavellin kanssa.
Paavi ehdottaa liittolaisuutta vastustaakseen Ranskan hyökkäystä. Della Rovere haluaa valloittaa Italian.
Della Roveren valloitussota etenee voitokkaasti italialaisten aatelisten siirtyessä heidän lippunsa alle.
Paavi pohtii kohtaloaan ranskalaisten vallatessa kaupungin vailla vastarintaa. Valloittajat vangitsevat Lucrezian.
Lucrezia synnyttää lapsen. Borgiat saavat avioliiton peruutetuksi ja suunnittelevat kostoa vihollisilleen.